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新冠病毒蛋白結構模型資源庫面世 有望促進相關藥物和疫苗的研發
時間:2020-06-06      來源:科技日報




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一個國際團隊創建了一個新冠病毒蛋白質結構模型資源庫,

可作為有力的分析工具,幫助科學家更好地理解新冠病毒。

圖片來源:物理學家組織網


  科技日報記者 劉霞

  據物理學家組織網近日報道,一個國際結構生物學家團隊對新冠病毒所包含蛋白質結構進行研究,并在此基礎上創建了一個名為“Web”的資源庫。該資源庫還包括對現有新冠病毒蛋白結構模型的評估等資源,可以幫助科學家更好地了解新冠病毒,促進新冠肺炎藥物和疫苗的研發工作。

  了解新冠病毒蛋白質的結構對于開發新冠肺炎療法和疫苗至關重要。最新研究負責人、美國弗吉尼亞大學結構生物學家瓦勒德克·邁耶爾說:“我們仔細分析了現有新冠病毒蛋白模型,并給出了結果,旨在幫助生物醫學界。結構模型是其他科學家對病毒蛋白理解的體現,有時并不那么優異,因此,驗證重要結構非常關鍵。大多數情況下,我們只提出了較小的修正建議。但在某些情況下,修正意義重大,特別是在蛋白質—配體復合物領域,這對于藥物研發等后續研究至關重要。”

  當新冠病毒席卷全球時,全世界科學家以前所未有的速度做出反應,確定病毒的原子結構及其蛋白質的組成,并為此構建出了各種新冠病毒蛋白質的結構模型。

  研究人員正在各種應用中使用這些結構模型,從基于結構的藥物設計到規劃一系列生物醫學實驗等。因此,這些原子模型必須盡可能準確。由于新冠肺炎大流行病來勢洶洶,在發表和同行評審之前,這些結構大多數都存放在“蛋白質數據庫”(PDB)中,這是一個大分子結構的全球數據存儲庫。

  邁耶爾所在團隊的成員都是結構驗證和解釋領域的專家,他們注意到可以使用最新方法改進幾種新冠病毒模型,正是在此動機的驅使下,他們創建了新的Web資源庫。該資源庫與PDB同步,每周更新一次,以確保該資源庫包含的模型都是最準確的模型。





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