科學(xué)家利用大規(guī)模比較基因組學(xué)繪制A群鏈球菌候選疫苗圖譜
近日，澳大利亞昆士蘭大學(xué)等科研人員在Nature Genetics上發(fā)表了題為“Atlas of group Astreptococcalvaccine candidates compiled using large-scale comparative genomics”的文章，利用大規(guī)模比較基因組學(xué)繪制A群鏈球菌候選疫苗圖譜。
A群鏈球菌（Group Astreptococcus，GAS）也稱化膿性鏈球菌（Streptococcus pyogenes），是鏈球菌中對人類致病力最強的細菌，其引起的疾病約占人類鏈球菌感染的90%。GAS在整個現(xiàn)代醫(yī)學(xué)史上一直是對科學(xué)家和臨床醫(yī)生的挑戰(zhàn)。即使在合適的抗生素治療的情況下，GAS造成的侵襲性感染仍導(dǎo)致高死亡率的發(fā)生。然而，迄今為止仍然沒有安全有效的GAS疫苗。
在本研究中，科研人員利用DNA高通量測序技術(shù)在疫苗設(shè)計中的優(yōu)勢，分析了世界范圍內(nèi)采樣獲得的2083個GAS基因組。GAS種群結(jié)構(gòu)顯示了由同源重組引起的廣泛的基因組異質(zhì)性，并被可塑性水平較高的附屬基因所覆蓋。科研人員在22個國家發(fā)現(xiàn)了超過290個臨床相關(guān)的基因組系統(tǒng)群，這對全球?qū)嵱眯砸呙绲脑O(shè)計具有一定的挑戰(zhàn)性。為了確定候選疫苗覆蓋率，科研人員研究了先前報道的所有GAS候選抗原的基因攜帶和基因序列異質(zhì)性情況，發(fā)現(xiàn)在28個候選疫苗抗原中，只有15個候選疫苗抗原的序列自然變異較低，同時對GAS種群的覆蓋率（>99%）較高。這一疫苗覆蓋率測定技術(shù)平臺同樣適用于在未來研究中對前瞻性GAS疫苗抗原的鑒定。（摘譯自Nature Genetics ,Published:27 May 2019）
