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Scientific Reports：首張人體肺部的脂質(zhì)組圖譜
美國(guó)太平洋西北國(guó)家實(shí)驗(yàn)室和羅切斯特大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)近日利用質(zhì)譜分析技術(shù)，繪制出第一張人體器官特異的脂質(zhì)組圖譜 – 肺部。這項(xiàng)成果于本周發(fā)表在《Scientific Reports》雜志上。
近年來，不同類型細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組已經(jīng)陸續(xù)發(fā)布，包括大腦、心臟和肝臟中的主要細(xì)胞類型，這些有助于我們更好地了解人體每個(gè)器官的功能。不過到目前為止，還沒有類似的脂質(zhì)組（lipidome）圖譜。
美國(guó)太平洋西北國(guó)家實(shí)驗(yàn)室和羅切斯特大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)近日利用質(zhì)譜分析技術(shù)，繪制出第一張人體器官特異的脂質(zhì)組圖譜 – 肺部。這項(xiàng)成果于本周發(fā)表在《Scientific Reports》雜志上。
“對(duì)人體肺部各個(gè)細(xì)胞類型的脂質(zhì)組進(jìn)行鑒定，將有助于我們更好地了解肺部形成和功能的調(diào)控過程，”研究團(tuán)隊(duì)在論文中指出。“基于液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜（LC-MS/MS）的脂質(zhì)組學(xué)為檢測(cè)生物樣本的脂質(zhì)組學(xué)特征提供了一種以無偏向的強(qiáng)大方法。”
研究人員從三名20個(gè)月大的捐贈(zèng)者那里獲得了肺部組織樣本。他們利用熒光激活細(xì)胞分選（FACS）技術(shù)，分離出四種主要的細(xì)胞類型：內(nèi)皮細(xì)胞，上皮細(xì)胞，間充質(zhì)細(xì)胞和混合免疫細(xì)胞。之后通過LC-MS/MS分析每種細(xì)胞類型特定的脂質(zhì)組和蛋白質(zhì)組。
為了鑒定和量化所得到的脂質(zhì)數(shù)據(jù)，研究人員使用了一種開源軟件LIQUID，這是他們?cè)谌ツ隇橹|(zhì)鑒定而開發(fā)的。他們發(fā)現(xiàn)了多種不同的脂質(zhì)，具體包括5種脂類和21種亞類中的311種獨(dú)特脂質(zhì)。這份獨(dú)特的圖譜似乎揭示了肺細(xì)胞如何相互作用和合作。
“基于LC-MS/MS的四種肺細(xì)胞的脂質(zhì)組學(xué)分析突出了各種細(xì)胞的獨(dú)特圖譜，揭示了肺臟內(nèi)高度相關(guān)且協(xié)調(diào)的細(xì)胞網(wǎng)絡(luò)，它們支持關(guān)鍵的氣體交換功能和先天宿主反應(yīng)，”研究人員總結(jié)道。
“這些細(xì)胞類型特異的脂質(zhì)數(shù)據(jù)，再加上細(xì)胞類型特異的轉(zhuǎn)錄物和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)，為研究肺部發(fā)育和功能提供了豐富資源，”他們寫道。（生物通 薄荷）
原文檢索
Cell type-resolved human lung lipidome reveals cellular cooperation in lung function
Scientific Reportsvolume 8, Article number: 13455 (2018)
