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DNA“甲基化指紋”鑒定出91種腫瘤
科技日?qǐng)?bào)北京3月18日電（記者張夢(mèng)然）英國(guó)《自然》雜志近日在線(xiàn)發(fā)表了一項(xiàng)癌癥研究成果，歐洲科學(xué)家研發(fā)了一種全新機(jī)器學(xué)習(xí)程序，通過(guò)DNA甲基化數(shù)據(jù)——“甲基化指紋”技術(shù)可以改善腦腫瘤的診斷。
正確診斷腫瘤，對(duì)于癌癥的治療至關(guān)重要。但是，在已知的約100種腫瘤中，中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤尤其難以準(zhǔn)確鑒定出來(lái)。
為了解決這個(gè)問(wèn)題，德國(guó)癌癥研究中心科學(xué)家斯蒂凡·普菲斯特及其同事開(kāi)發(fā)了一個(gè)機(jī)器學(xué)習(xí)程序，它可以對(duì)甲基化數(shù)據(jù)進(jìn)行分類(lèi)。甲基化是甲基分子附著到DNA上從而改變DNA內(nèi)信息可用性的過(guò)程。這個(gè)過(guò)程不僅會(huì)自然發(fā)生在細(xì)胞功能正常發(fā)揮期間，使每個(gè)細(xì)胞獲得一個(gè)特有的“甲基化指紋”，它也會(huì)發(fā)生在疾病（如癌癥）中。因此，甲基化可以揭示有關(guān)腫瘤類(lèi)型的信息，“告訴”人們這些腫瘤由什么類(lèi)型的細(xì)胞形成。
研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)出來(lái)的程序經(jīng)過(guò)訓(xùn)練后，可以使用“甲基化指紋”鑒定91種腫瘤。訓(xùn)練采用的參照數(shù)據(jù)，來(lái)自約2800名癌癥患者。研究人員在1104例已經(jīng)經(jīng)過(guò)人工檢查的中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤上進(jìn)行了測(cè)試，認(rèn)為該程序不僅可以提高診斷準(zhǔn)確率，而且它的客觀性還使之可以如實(shí)鑒定出新型罕見(jiàn)腫瘤——人工檢查時(shí)，會(huì)面對(duì)根據(jù)已知腫瘤類(lèi)型進(jìn)行診斷的壓力，甚至在非典型病例中也是如此。
為了讓這種新方法得到廣泛應(yīng)用，研究團(tuán)隊(duì)稍早時(shí)間生成了一款免費(fèi)在線(xiàn)工具，可以在區(qū)區(qū)幾分鐘內(nèi)分析上傳的數(shù)據(jù)。自上線(xiàn)以來(lái)，該工具已被使用逾4500次，用戶(hù)可以選擇分享他們的數(shù)據(jù)，以便進(jìn)一步優(yōu)化算法。研究人員總結(jié)表示，將“甲基化指紋”與腦腫瘤自動(dòng)分類(lèi)器整合起來(lái)，還可以提供一個(gè)藍(lán)圖——?jiǎng)?chuàng)造類(lèi)似的腫瘤分類(lèi)算法以用于診斷更多其他癌癥類(lèi)型。
