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青島能源所實(shí)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)靜電相互作用的直接測(cè)量
時(shí)間:2021-11-19      來(lái)源:中國(guó)科學(xué)院青島生物能源與過(guò)程研究所


 靜電相互作用在許多重要生物反應(yīng)過(guò)程中起到至關(guān)重要的作用,如酶催化、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)-DNA/RNA相互作用和H+的轉(zhuǎn)移等生物反應(yīng)。但絕大多數(shù)蛋白質(zhì)都是在細(xì)胞中執(zhí)行其功能,復(fù)雜細(xì)胞環(huán)境可以擾動(dòng)蛋白質(zhì)的靜電相互作用,這對(duì)蛋白質(zhì)功能的實(shí)施非常重要,但這種擾動(dòng)能達(dá)到何種程度目前尚不清楚。

 近日,青島能源所姚禮山研究員帶領(lǐng)的蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)研究組,在細(xì)胞內(nèi)原位定量測(cè)量蛋白質(zhì)靜電相互作用取得重要進(jìn)展。該研究應(yīng)用核磁共振技術(shù)和雙突變循環(huán)的(double? mutational cycle,DMC)方法,測(cè)量了細(xì)胞內(nèi)IgG結(jié)合蛋白質(zhì)GB3中的8對(duì)電荷相互作用,并與在胞外條件測(cè)量的結(jié)果進(jìn)行比較。研究結(jié)果表明,蛋白質(zhì)GB3中5對(duì)電荷的靜電相互作用沒(méi)有明顯變化,另外3對(duì)電荷的靜電相互作用減弱了70%以上(圖1)。進(jìn)一步的研究表明,細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)靜電相互作用強(qiáng)弱與蛋白質(zhì)折疊轉(zhuǎn)移自由能有關(guān),折疊態(tài)和解折疊態(tài)的轉(zhuǎn)移自由能都影響細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)靜電相互作用,盡管后者通常比前者的影響更大(圖2)。研究結(jié)果凸顯了在細(xì)胞內(nèi)直接研究蛋白質(zhì)相互作用和蛋白質(zhì)功能的重要性。

 上述工作近日發(fā)表于《Journal of the American Chemical Society》雜志上。第一作者是青島能源所的副研究員宋鄉(xiāng)飛和博士生王夢(mèng)婷,通訊作者是青島能源所的姚禮山研究員。該工作得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金、山東省人才項(xiàng)目、中國(guó)科學(xué)院青促會(huì)項(xiàng)目和山東能源研究院科研創(chuàng)新基金等項(xiàng)目的支持。(文/圖 宋鄉(xiāng)飛 王夢(mèng)婷 姚禮山)


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圖1. 在胞外條件和細(xì)胞內(nèi)測(cè)量的GB3電荷對(duì)之間靜電相互作用的相關(guān)性


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圖2. 蛋白質(zhì)折疊轉(zhuǎn)移自由能(ΔGtr)的性質(zhì):A) 所有測(cè)量的GB3突變體的折疊轉(zhuǎn)移自由能; B)和C)分別為折疊轉(zhuǎn)移自由能和折疊態(tài)相對(duì)轉(zhuǎn)移自由能及解折疊態(tài)相對(duì)轉(zhuǎn)移自由能之間的相關(guān)性。


 原文鏈接:https://doi.org/10.1021/jacs.1c10154

 Xiangfei Song#, Mengting Wang#, Xiaoxu Chen, Xueying Zhang, Ying Yang, Zhijun Liu, and Lishan Yao*, Quantifying Protein Electrostatic Interactions in Cells by Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy, Journal of the American Chemical Society, 2021 (DOI: 10.1021/jacs.1c10154).


 供稿部門:蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)研究組




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